AmitkStudy

AmitkStudy

Synopsis

#define             AMITK_STUDY_VIEW_CENTER             (stu)
#define             AMITK_STUDY_VIEW_THICKNESS          (stu)
#define             AMITK_STUDY_ZOOM                    (stu)
#define             AMITK_STUDY_FOV                     (stu)
#define             AMITK_STUDY_VIEW_START_TIME         (stu)
#define             AMITK_STUDY_VIEW_DURATION           (stu)
#define             AMITK_STUDY_CREATION_DATE           (stu)
#define             AMITK_STUDY_FILENAME                (stu)
#define             AMITK_STUDY_VOXEL_DIM               (stu)
#define             AMITK_STUDY_VOXEL_DIM_VALID         (stu)
#define             AMITK_STUDY_FUSE_TYPE               (stu)
#define             AMITK_STUDY_VIEW_MODE               (stu)
#define             AMITK_STUDY_CANVAS_VISIBLE          (stu, canvas)
#define             AMITK_STUDY_CANVAS_TARGET           (stu)
#define             AMITK_STUDY_CANVAS_ROI_WIDTH        (stu)
#define             AMITK_STUDY_CANVAS_LINE_STYLE       (stu)
#define             AMITK_STUDY_CANVAS_FILL_ROI         (stu)
#define             AMITK_STUDY_CANVAS_LAYOUT           (stu)
#define             AMITK_STUDY_CANVAS_MAINTAIN_SIZE    (stu)
#define             AMITK_STUDY_CANVAS_TARGET_EMPTY_AREA(stu)
#define             AMITK_STUDY_PANEL_LAYOUT            (stu)
#define             AMITK_STUDY_LINE_PROFILE            (stu)
enum                AmitkFuseType;
                    AmitkStudy;
AmitkStudy *        amitk_study_new                     (AmitkPreferences *preferences);
void                amitk_study_set_filename            (AmitkStudy *study,
                                                         const gchar *new_filename);
void                amitk_study_set_creation_date       (AmitkStudy *study,
                                                         const gchar *new_date);
void                amitk_study_set_view_thickness      (AmitkStudy *study,
                                                         const amide_real_t new_thickness);
void                amitk_study_set_view_center         (AmitkStudy *study,
                                                         const AmitkPoint new_center);
void                amitk_study_set_view_start_time     (AmitkStudy *study,
                                                         const amide_time_t new_start);
void                amitk_study_set_view_duration       (AmitkStudy *study,
                                                         const amide_time_t new_duration);
void                amitk_study_set_fuse_type           (AmitkStudy *study,
                                                         const AmitkFuseType new_fuse_type);
void                amitk_study_set_view_mode           (AmitkStudy *study,
                                                         const AmitkViewMode new_view_mode);
void                amitk_study_set_canvas_visible      (AmitkStudy *study,
                                                         const AmitkView view,
                                                         const gboolean visible);
void                amitk_study_set_zoom                (AmitkStudy *study,
                                                         const amide_real_t new_zoom);
void                amitk_study_set_fov                 (AmitkStudy *study,
                                                         const amide_real_t new_fov);
void                amitk_study_set_canvas_target       (AmitkStudy *study,
                                                         const gboolean always_on);
void                amitk_study_set_canvas_roi_width    (AmitkStudy *study,
                                                         gint roi_width);
void                amitk_study_set_canvas_line_style   (AmitkStudy *study,
                                                         const GdkLineStyle line_style);
void                amitk_study_set_canvas_fill_roi     (AmitkStudy *study,
                                                         const gboolean fill_roi);
void                amitk_study_set_canvas_layout       (AmitkStudy *study,
                                                         const AmitkLayout layout);
void                amitk_study_set_canvas_maintain_size
                                                        (AmitkStudy *study,
                                                         const gboolean maintain_size);
void                amitk_study_set_canvas_target_empty_area
                                                        (AmitkStudy *study,
                                                         gint target_empty_area);
void                amitk_study_set_panel_layout        (AmitkStudy *study,
                                                         const AmitkPanelLayout panel_layout);
AmitkStudy *        amitk_study_recover_xml             (const gchar *study_filename,
                                                         AmitkPreferences *preferences);
AmitkStudy *        amitk_study_load_xml                (const gchar *study_filename);
gboolean            amitk_study_save_xml                (AmitkStudy *study,
                                                         const gchar *study_filename,
                                                         const gboolean save_as_directory);
const gchar *       amitk_fuse_type_get_name            (const AmitkFuseType fuse_type);
const gchar *       amitk_view_mode_get_name            (const AmitkViewMode view_mode);

Description

Details

AMITK_STUDY_VIEW_CENTER()

#define AMITK_STUDY_VIEW_CENTER(stu)              (amitk_space_s2b(AMITK_SPACE(stu), AMITK_STUDY(stu)->view_center))

stu :


AMITK_STUDY_VIEW_THICKNESS()

#define AMITK_STUDY_VIEW_THICKNESS(stu)           (AMITK_STUDY(stu)->view_thickness)

stu :


AMITK_STUDY_ZOOM()

#define AMITK_STUDY_ZOOM(stu)                     (AMITK_STUDY(stu)->zoom)

stu :


AMITK_STUDY_FOV()

#define AMITK_STUDY_FOV(stu)                      (AMITK_STUDY(stu)->fov)

stu :


AMITK_STUDY_VIEW_START_TIME()

#define AMITK_STUDY_VIEW_START_TIME(stu)          (AMITK_STUDY(stu)->view_start_time)

stu :


AMITK_STUDY_VIEW_DURATION()

#define AMITK_STUDY_VIEW_DURATION(stu)            (AMITK_STUDY(stu)->view_duration)

stu :


AMITK_STUDY_CREATION_DATE()

#define AMITK_STUDY_CREATION_DATE(stu)            (AMITK_STUDY(stu)->creation_date)

stu :


AMITK_STUDY_FILENAME()

#define AMITK_STUDY_FILENAME(stu)                 (AMITK_STUDY(stu)->filename)

stu :


AMITK_STUDY_VOXEL_DIM()

#define AMITK_STUDY_VOXEL_DIM(stu)                (AMITK_STUDY(stu)->voxel_dim)

stu :


AMITK_STUDY_VOXEL_DIM_VALID()

#define AMITK_STUDY_VOXEL_DIM_VALID(stu)          (AMITK_STUDY(stu)->voxel_dim_valid)

stu :


AMITK_STUDY_FUSE_TYPE()

#define AMITK_STUDY_FUSE_TYPE(stu)                (AMITK_STUDY(stu)->fuse_type)

stu :


AMITK_STUDY_VIEW_MODE()

#define AMITK_STUDY_VIEW_MODE(stu)                (AMITK_STUDY(stu)->view_mode)

stu :


AMITK_STUDY_CANVAS_VISIBLE()

#define AMITK_STUDY_CANVAS_VISIBLE(stu, canvas)   (AMITK_STUDY(stu)->canvas_visible[canvas])

stu :

canvas :


AMITK_STUDY_CANVAS_TARGET()

#define AMITK_STUDY_CANVAS_TARGET(stu)            (AMITK_STUDY(stu)->canvas_target)

stu :


AMITK_STUDY_CANVAS_ROI_WIDTH()

#define AMITK_STUDY_CANVAS_ROI_WIDTH(stu)         (AMITK_STUDY(stu)->canvas_roi_width)

stu :


AMITK_STUDY_CANVAS_LINE_STYLE()

#define AMITK_STUDY_CANVAS_LINE_STYLE(stu)        (AMITK_STUDY(stu)->canvas_line_style)

stu :


AMITK_STUDY_CANVAS_FILL_ROI()

#define AMITK_STUDY_CANVAS_FILL_ROI(stu)          (AMITK_STUDY(stu)->canvas_fill_roi)

stu :


AMITK_STUDY_CANVAS_LAYOUT()

#define AMITK_STUDY_CANVAS_LAYOUT(stu)            (AMITK_STUDY(stu)->canvas_layout)

stu :


AMITK_STUDY_CANVAS_MAINTAIN_SIZE()

#define AMITK_STUDY_CANVAS_MAINTAIN_SIZE(stu)     (AMITK_STUDY(stu)->canvas_maintain_size)

stu :


AMITK_STUDY_CANVAS_TARGET_EMPTY_AREA()

#define AMITK_STUDY_CANVAS_TARGET_EMPTY_AREA(stu) (AMITK_STUDY(stu)->canvas_target_empty_area)

stu :


AMITK_STUDY_PANEL_LAYOUT()

#define AMITK_STUDY_PANEL_LAYOUT(stu)             (AMITK_STUDY(stu)->panel_layout)

stu :


AMITK_STUDY_LINE_PROFILE()

#define AMITK_STUDY_LINE_PROFILE(stu)             (AMITK_STUDY(stu)->line_profile)

stu :


enum AmitkFuseType

typedef enum {
  AMITK_FUSE_TYPE_BLEND,
  AMITK_FUSE_TYPE_OVERLAY,
  AMITK_FUSE_TYPE_NUM
} AmitkFuseType;


AmitkStudy

typedef struct {
  AmitkObject parent;

  gchar * creation_date; /* when this study was created */

  /* canvas view parameters */
  AmitkPoint view_center; /* wrt the study coordinate space */
  amide_real_t view_thickness;
  amide_time_t view_start_time;
  amide_time_t view_duration;
  amide_real_t zoom;
  amide_real_t fov; /* field of view, in percent */
  AmitkFuseType fuse_type;
  AmitkViewMode view_mode;
  gboolean canvas_visible[AMITK_VIEW_NUM];
  gboolean canvas_target; /* target on/off */

  /* canvas preferences */
  gint canvas_roi_width;
  GdkLineStyle canvas_line_style;
  gboolean canvas_fill_roi;
  AmitkLayout canvas_layout;
  gboolean canvas_maintain_size;
  gint canvas_target_empty_area; /* in pixels */
  AmitkPanelLayout panel_layout;

  /* stuff calculated when file is loaded and stored */
  amide_real_t voxel_dim; /* prefered voxel/pixel dim, canvas wants this info */
  gboolean voxel_dim_valid;

  /* stuff that doesn't need to be saved */
  AmitkLineProfile * line_profile;
  gchar * filename; /* file name of the study */
} AmitkStudy;


amitk_study_new ()

AmitkStudy *        amitk_study_new                     (AmitkPreferences *preferences);

preferences :

Returns :


amitk_study_set_filename ()

void                amitk_study_set_filename            (AmitkStudy *study,
                                                         const gchar *new_filename);

study :

new_filename :


amitk_study_set_creation_date ()

void                amitk_study_set_creation_date       (AmitkStudy *study,
                                                         const gchar *new_date);

study :

new_date :


amitk_study_set_view_thickness ()

void                amitk_study_set_view_thickness      (AmitkStudy *study,
                                                         const amide_real_t new_thickness);

study :

new_thickness :


amitk_study_set_view_center ()

void                amitk_study_set_view_center         (AmitkStudy *study,
                                                         const AmitkPoint new_center);

study :

new_center :


amitk_study_set_view_start_time ()

void                amitk_study_set_view_start_time     (AmitkStudy *study,
                                                         const amide_time_t new_start);

study :

new_start :


amitk_study_set_view_duration ()

void                amitk_study_set_view_duration       (AmitkStudy *study,
                                                         const amide_time_t new_duration);

study :

new_duration :


amitk_study_set_fuse_type ()

void                amitk_study_set_fuse_type           (AmitkStudy *study,
                                                         const AmitkFuseType new_fuse_type);

study :

new_fuse_type :


amitk_study_set_view_mode ()

void                amitk_study_set_view_mode           (AmitkStudy *study,
                                                         const AmitkViewMode new_view_mode);

study :

new_view_mode :


amitk_study_set_canvas_visible ()

void                amitk_study_set_canvas_visible      (AmitkStudy *study,
                                                         const AmitkView view,
                                                         const gboolean visible);

study :

view :

visible :


amitk_study_set_zoom ()

void                amitk_study_set_zoom                (AmitkStudy *study,
                                                         const amide_real_t new_zoom);

study :

new_zoom :


amitk_study_set_fov ()

void                amitk_study_set_fov                 (AmitkStudy *study,
                                                         const amide_real_t new_fov);

study :

new_fov :


amitk_study_set_canvas_target ()

void                amitk_study_set_canvas_target       (AmitkStudy *study,
                                                         const gboolean always_on);

study :

always_on :


amitk_study_set_canvas_roi_width ()

void                amitk_study_set_canvas_roi_width    (AmitkStudy *study,
                                                         gint roi_width);

study :

roi_width :


amitk_study_set_canvas_line_style ()

void                amitk_study_set_canvas_line_style   (AmitkStudy *study,
                                                         const GdkLineStyle line_style);

study :

line_style :


amitk_study_set_canvas_fill_roi ()

void                amitk_study_set_canvas_fill_roi     (AmitkStudy *study,
                                                         const gboolean fill_roi);

study :

fill_roi :


amitk_study_set_canvas_layout ()

void                amitk_study_set_canvas_layout       (AmitkStudy *study,
                                                         const AmitkLayout layout);

study :

layout :


amitk_study_set_canvas_maintain_size ()

void                amitk_study_set_canvas_maintain_size
                                                        (AmitkStudy *study,
                                                         const gboolean maintain_size);

study :

maintain_size :


amitk_study_set_canvas_target_empty_area ()

void                amitk_study_set_canvas_target_empty_area
                                                        (AmitkStudy *study,
                                                         gint target_empty_area);

study :

target_empty_area :


amitk_study_set_panel_layout ()

void                amitk_study_set_panel_layout        (AmitkStudy *study,
                                                         const AmitkPanelLayout panel_layout);

study :

panel_layout :


amitk_study_recover_xml ()

AmitkStudy *        amitk_study_recover_xml             (const gchar *study_filename,
                                                         AmitkPreferences *preferences);

study_filename :

preferences :

Returns :


amitk_study_load_xml ()

AmitkStudy *        amitk_study_load_xml                (const gchar *study_filename);

study_filename :

Returns :


amitk_study_save_xml ()

gboolean            amitk_study_save_xml                (AmitkStudy *study,
                                                         const gchar *study_filename,
                                                         const gboolean save_as_directory);

study :

study_filename :

save_as_directory :

Returns :


amitk_fuse_type_get_name ()

const gchar *       amitk_fuse_type_get_name            (const AmitkFuseType fuse_type);

fuse_type :

Returns :


amitk_view_mode_get_name ()

const gchar *       amitk_view_mode_get_name            (const AmitkViewMode view_mode);

view_mode :

Returns :