In addition to manually aligning data sets (described at “Alineación Manual de Volúmenes”), data sets can also be aligned using the alignment wizard utilizing either mutual information or fiducial markers.
A rigid body alignment can be performed utilizing mutual information between two data sets. This algorithm works by taking orthogonal slices from one data set (transverse, coronal, and sagittal) and computing a transform to best allow matching of these slices to the second data set. This algorithm works best when the two data sets have already been roughly aligned. Note that the orthogonal slices utilized for the matching are derived utilizing the current viewing parameters (current viewing location, slice width, interpolation method, etc).
A rigid body alignment can be performed utilizing fiducial markers. The process is basically:
Dibujar al menos 3 pares de puntos fiduciales en los volúmenes que desee alinear. El dibujo de puntos fiduciales se describe debajo como “Dibujando Marcadores Fiduciales”.
Corra el "alignment wizard" (bajo tools->alignment wizard). para que el "alignment wizard" reconozca 2 marcadores fiduciales como par, deben de tener exactamente el mismo nombre. Así si tiene un marcador llamado "1" en el primer volumen, tendrá que tener un marcador, también llamado "1", en el segundo volumen.
Se pueden añadir marcadores fiduciales de varias maneras. Para el volumen activo, seleccionar el item del menu "Edit->Add fiducial mark" y añadirá una marca fiducial en la vista seleccionada. Las marcas fiduciales se pueden añadir directamente a la vista activa pulsando CTRL+botón 3 del raton, que dispondrá una marca fiducial en el lugar que apunte el ratón. Finalmente, los marcadores fiduciales se pueden añadir a volúmenes inactivos pulsando CTRL+botón 3 del ratón mientras se selecciona el volumen de la lista del estudio.
Después de crear, el marcador fiducial puede ser movido pulsando el punto de marcaje en cualquiera de las tres vistas.
Para modificar los parámetros de una marca fiducial, pulse el botón 3 en la lista del estudio para desplegar la Caja de Diálogo de Modificación de Marcadores Fiduciales. Desde este diálogo, se pueden modificar el nombre y localización del marcador fiducial.
Permite recortar los volúmenes quitando de ellos las partes carentes de interés. Se abrirá un diálogo con el MIP del plano axial, existiendo unos modificadores de dimensión que dibujarán una caja en el MIP, una vez seleccionado pulsar Next y aparecerá el MIP coronal, ajustarlo y pulsar Next de nuevo aparecerá el MIP sagital, recortando así, el volumen desde los 2 planos.
The factor analysis wizard is currently being developed. It probably won't work for you, and is only included in AMIDE for those who might be interested in working on it (rather than with it).
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Nota, los resultados son mejores si se usa interpolación trilineal.
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The left and right limits of the gaussian fit can be altered by clicking on the profile with the left and right mouse buttons, respectively. The x value used for initializing the gaussian fit can be picked by clicking on the profile with the middle mouse button.
Note that the line profile is extracted from the currently viewed image, not the underlying raw data itself. This means things like the current interpolation and FOV will effect the line profile that's generated, and as such may effect the FWHM that's fitted.
La descripción de la estadísticas del ROI en: “Calculando Estadísticas”.